Yakutiye Medresesinin kuzeybatı köşesinde bulunan kümbete, medresenin içinden girilmektedir. Medresenin kuzeydoğu köşesindeki bölümden çift yönlü merdivenle kümbetin üst katına, merdivenin altından da cenazelik bölümüne bağlantı sağlanmıştır. Kümbetin içerisi 5.10 m. çapında daire planlı olarak düzenlenmiştir. İçten kubbeli olan kümbetin güney duvarında yüzeysel sade bir mihrap nişi bulunmaktadır. Kümbetin batı penceresi sivri kemer içerisinde beş sıra mukarnaslı kavsaraya sahip düz atkıtaşlı dikdörtgen olup, medresenin baş eyvanına açılmaktadır. yuvarlak gövdeli ve konik külahlıdır. Türbenin gövde çapı 4.65, duvarları da 0.95 m. kalınlığındadır. Türbenin üzerinde düz lentolu iki pencere bulunmaktadır. Külah kısmının altı gövdeden bir döşeme ile ayrılmıştır.
Türbenin altındaki mumyalık kısmının üzerinde bulunan zemindeki sandukada kitabe bulunmamaktadır.